중앙재난안전대책본부는 충북 옥천군에서 질병관리본부에서 정한 신종플루 예방접종 일정을 준수하지 않고 임의로 예방접종을 실시 하였다는 보도와 관련, 각 지방자치단체에 대해 당초 질병관리본부에서 정한 예방접종 일정을 준수토록 지시하였다.

각 지역대책본부는 교육청, 보건소 등 관계기관과의 협의를 통해 대응체계에 혼선이 초래되지 않도록 행정지도를 철저히 해줄 것을 지시하였다.